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Ubuntu+python将nii图像保存成png格式

python 搞代码 4年前 (2022-01-08) 16次浏览 已收录 0个评论

这篇文章主要介绍了Ubuntu+python将nii图像保存成png格式,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧

这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。

这篇文章是介绍多个nii文件保存为png格式的方法:

系统:Ubuntu 16.04

软件: python 3.5

先用pip安装nibabel、numpy、imageio、os。

 import nibabel as nib import numpy as np import imageio import os def read_niifile(niifile):   #读取niifile文件 img = nib.load(niifile)   #下载niifile文件(其实是提取文件) img_fdata = img.get_fdata()  #获取niifile数据 return img<div style="color:transparent">来源gaodai.ma#com搞#代!码网</div>_fdata def save_fig(file):     #保存为图片 fdata = read_niifile(file)  #调用上面的函数,获得数据 (x,y,z) = fdata.shape   #获得数据shape信息:(长,宽,维度-切片数量) for k in range(z): silce = fdata[k,:,:]   #三个位置表示三个不同角度的切片 imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png-600'.format(k)),silce) #将切片信息保存为png格式 dir = './.nii'      #nii的路径 savepicdir = ''      #保存png的路径 os.mkdir(savepicdir)     #创建文件夹 save_fig(dir)      #运行程序,保存为图像 

不要忘记返回img_fdata,否则下一个文件会报错。

以上就是Ubuntu+python将nii图像保存成png格式的详细内容,更多请关注gaodaima搞代码网其它相关文章!


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