这篇文章主要介绍了python读取.mtx文件的操作，具有很好的参考价值，希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
mtx文件是按照稀疏矩阵格式存储的矩阵数据，可以按照以下步骤读取：
1、安装scanpy包
pip install scanpy
2、文件读取
import scanpy as sc adata = sc.read(filename) data = adata.X
第一行read之后返回的是annData，第二行通过.X操作得到的是矩阵数据
3、转换为稠密矩阵
data = data.todense()
直接得到的矩阵是稀疏形式的，通过todense函数可转换为稠密矩阵
补充：python读取各种文件方式
Json：
use_time=[] with open(address,'r') as f: #ubuntu mobile = json.load(f) calls = mobile["transactions"][0]["calls"] for call in calls: use_time.append(str(call['use_time']))
Excel：
rawdata1=open_workbook(address) rawdata=rawdata1.sheet_by_index(0) for i in range(1,rawdata.nrows): if rawdata.cell(i,date_index).value=="": #跳过空行 continue else: if ctype==3: #若为3，则用datetime模块处理日期 date1=rawdata.cell(i,date_index).value date2 = xldate_as_tuple(date1,0) date3=datetime(*date2) if "." in str(rawdata.cell(i,phone_index).value): phone1=str(rawdata.cell(i,phone_index).value)[:-2] else: phone1=str(rawdata.cell(i,phone_index).value)
写EXCEL：
Excel_file = xlwt.Workbook() <strong style="color:transparent">来源gaodaima#com搞(代@码网</strong>sheet = Excel_file.add_sheet('sheet0') header=[u'号码','日期top1','日期top2','日期top3'] #写入标题行： for i in range(len(header)): sheet.write(0,i,header[i]) #开始按行写入数据： for i in range(len(phonelist)): sheet.write(i+1,0,phonelist[i]) sheet.write(i+1,1,dic[str(phonelist[i])]) #保存EXCEL： Excel_file.save("C:/Users/Desktop/100个文件输出xls/"+str(fileName)+".xls")
CSV：
rawdata=pd.read_csv(address,skip_blank_lines=True) #参数为去除空行 if 'start_time' or 'begin_time' in rawdata.columns: if 'start_time' in rawdata.columns: start_time=rawdata['start_time'] elif 'begin_time' in rawdata.columns: start_time=rawdata['begin_time']
txt：
rawdata=open(address,'r') i=0 a=[] #c存放第一行的列名 for line in rawdata: if i==1: #默认第二行开始存储通话数据 a=line.split(',') #逗号作为分隔符 for j in range(len(a)): #查找指定列名所在的列下标 if (('-' in str(a[j]))or('/' in str(a[j]))): #判断日期所在列数 date_index=j #保存日期的列下标 elif str(a[j]).isdigit() and len(str(a[j]))>5: #默认全为数字组成的字符串为电话号码 phone_index=j else: pass break else: i+=1 i=0 for line in rawdata:#开始转存数据： if len(line)<10: #跳过空行 continue data_line=line.split(',') #txt默认以','分隔数据 if i==0: pass #第一行为列名，跳过 i+=1 else: #从第二行开始保存数据 start_time.append(data_line[date_index])
以上就是python如何读取.mtx文件的详细内容，更多请关注gaodaima搞代码网其它相关文章！
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