这篇文章主要介绍了python 提取文件指定列的方法示例，文中通过示例代码介绍的非常详细，对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值，需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧
之前用featureCount 处理得到结果，要提出第一列gene_id 和 readcount 列，首先软件输出的第一行默认是你使用的命令行，没有用，用bash批量删掉。
for i in `ls`;do sed -i '1d' $i;done
删除当前文件夹下所有文件第一行。
其实提出两列很简单，不过我受够了每次一个文件执行一次的烦。想搞成别的程序调用时命令行参数直接就行。第一次知道sys.argv这玩意，学到了。
我设置了 -i 输入，-o 输出 这两个参数来判断输入输出文件个数，不过对于错误命令行输入的判断还很欠缺来源gaodai#ma#com搞@代~码网，毕竟只有自己用。
上代码：
import sys leng=len(sys.argv) for i in range(leng): # index the input file and output file location,maybe it's too complex if sys.argv[i]=="-i": it=i if sys.argv[i]=="-o": out=i for i in range(it+1,out): # input file number(there should have same # of in and out file) print(sys.argv[i]) file=open(sys.argv[i],'r') f=open(sys.argv[i+out-it],'w') count=[] for lines in file.readlines(): two=[] lines=lines.rstrip('\n') b=lines.split('\t') two.append(b[0]) if(b[6].startswith('.')): #chage path to count,some output problem b[6]="count" two.append(b[6]) s='\t'.join(two) f.write(s+'\n') f.close
其实python里面 str 和list 弄的还是昏头昏脑的，每次都要错了再改。
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