今天小编就为大家分享一篇python读取dicom图像示例(SimpleITK和dicom包实现)，具有很好的参考价值，希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
1. 用SimpleITK读取dicom序列：
import SimpleITK as sitk import numpy as np img_path='F:\\dataset\\pancreas\\Output\\thick\\original\\1' mask_path='F:\\dataset\\pancreas\\Output\\thick\\groundtruth\\1' reader = sitk.ImageSeriesReader() img_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(img_path) reader.SetFileNames(img_names) image = reader.Execute() image_array = sitk.GetArrayFromImage(image) # z, y, x reader = sitk.ImageSeriesReader() mask_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(mask_path) reader.SetFileNames(mask_names) mask = reader.Execute() mask_array = sitk.GetArrayFromImage(mask) # z, y, x
2. 用dicom读取单张dicom图像并显示：
import dicom import pylab ds=dicom.read_file("F:\\dataset\\pancreas\\Output\\thick\\groundtruth\\1\\FILE0001_seg.dcm") pixel_bytes = ds.PixelData ##CT值组成了一个矩阵 pix = ds.pixel_array ##读取显示图片 pylab.imshow(ds.pixel_array, cmap=pylab.cm.bone)
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pylab.show() 如果要对dicom图像中的像素值进行修改，继续执行以下代码： ##修改图片中的元素，不能直接使用data_array,需要转换成PixelData for n,val in enumerate(ds.pixel_array.flat): # example: zero anything <300 if val
3. 此外，用pydicom也可读取dicom图像
以上这篇python读取dicom图像示例(SimpleITK和dicom包实现)就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持gaodaima搞代码网。
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