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.img/.hdr格式转.nii格式的操作

python 搞代码 4年前 (2022-01-07) 61次浏览 已收录 0个评论

这篇文章主要介绍了.img/.hdr格式转.nii格式的操作,具有很好的参考价值,希望来源gaodai#ma#com搞*!代#%^码$网对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧

MATLAB转格式,需要使用spm package(https://github.com/neurodebian/spm12).

 %%img2nii.m-------------------------------------------- %Script to convert hdr/img files to nii. %This script uses SPM function, so you need to install SPM5 or later. %Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014 %select files f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted'); %convert img files to nii for i=1:size(f,1) input = deblank(f(i,:)); [pathstr,fname,ext] = fileparts(input); output = strcat(fname,'.nii'); V=spm_vol(input); ima=spm_read_vols(V); V.fname=output; spm_write_vol(V,ima); end

附加一下volume data是如何转surface data的吧…

wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear

补充知识:数据读取――(.img .hdr)

1、定义

该图像格式含有两部分:一个是图像 ‘.img ‘,另一个是图像头文件 ‘.hdr’,该文件记录了图像的信息,如图像尺寸、波段数、数据类型和大小端等。如果缺少头文件,将无法对图像进行读取,因此头文件十分重要。

2、读取

使用Matlab中NifTi包读取。

eg:

img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr’)

以上这篇.img/.hdr格式转.nii格式的操作就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持gaodaima搞代码网

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