我在Windows Server 2003虚拟机上安装MySQL5.5（社区版）。这个虚拟机之前被别人安装过MySQL5.5和MySQL5.0，但是忘了root密码，所以重装。不出意外的遇到了配置MySQL Instance时MySQLInstanceConfig.exe没有响应的问题。（我记得以前遇到这个问题，就本文来源gao@!dai!ma.com搞$$代^@码!网!果断换了MySQL5.0，绕开却并未解决）
试了很多方法，有说需要以Administrator身份运行（据说WIN7上安装会是这个问题，而我用的是Windows Server 2003，本来登录的用户就是Administrator），有说要把安装目录和注册表删除干净的，但都没有成功。
最后查看C:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.5/my.ini，找到
basedir=”C:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.5/”
datadir=”C:/Documents and Settings/All Users/Application Data/MySQL/MySQL Server 5.5/Data/”
发现datadir所在的目录的确没有删除干净，于是删除整个目录C:/Documents and Settings/All Users/Application Data/MySQL/，卸载并重新安装，终于成功。
结论：
1、MySQL5.5在安装过MySQL的Windows上的确是出现MySQLInstanceConfig.exe没有响应的问题，MySQL5.0不会。
2、出现该问题的原因的确是上个MySQL实例卸载时没有卸载干净导致的，但清理垃圾最关键的不是注册表而是mysql datadir。
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